Фамилия Шабукова — женская форма от мужской Шабуков. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Шабук, которое могло принадлежать человеку с живым, непоседливым характером или необычной манерой держаться.

Корень здесь — шаб-, который в русских говорах давал целый ряд значений. В словаре Владимира Даля находим слово «шабурить» (южное, курское) — говорить без умолку, тараторить, болтать. Отсюда «шабура» — болтун, пустомеля. В северных говорах «шабурить» означало шуршать, шебуршать, производить возню. Таким образом, Шабуком могли прозвать и говорливого человека, и того, кто постоянно суетится, егозит. Есть и менее вероятная версия: от татарского «шабук» — быстрый, проворный, что в принципе близко по смыслу к русским диалектным значениям.

Модель образования простая и типичная для северных и центральных областей России: к основе Шабук прибавили суффикс -ов, указывающий на принадлежность. Первоначально Шабуков — это «сын Шабука» или «человек из семьи Шабука». Суффикс -ов, а не -ин, говорит о том, что прозвище оканчивалось на согласный, а не на -а/-я. Встречается и вариант Шабукин, но он менее распространён и образован от той же основы по другой модели.

Фамилия редкая, встречается в основном в Поволжье, особенно в Удмуртии и Кировской области, а также в Пермском крае. Это указывает на возможное переселение носителей прозвища с севера или северо-востока Русского государства. Сословная принадлежность предков могла быть любой — от крестьян до служилых людей, так как прозвище не несло социальной окраски. Известных исторических деятелей с такой фамилией в открытых источниках не зафиксировано — это фамилия «тихая», бытовая, сохранившаяся в своей локальной среде.