Фамилия Шабурдин образована от прозвища Шабурда. В русских говорах «шабурдой» называли непоседливого, суетливого человека, того, кто постоянно возится, шумит, производит беспорядок. Глагол «шабурдить» означает «шебуршать, шуршать, возиться с шумом», а также «путать, мешать». Скорее всего, прозвище дали человеку с беспокойным, хлопотливым характером или тому, кто работал неаккуратно, «шабурдил» на рабочем месте.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность — «сын Шабурды» или «из семьи Шабурды». Это патронимическая форма, распространённая в северных и центральных областях России. Обратите внимание: в основе нет тюркского или иноязычного следа, хотя звучание может показаться необычным. Родственные фамилии — Шабуркин, Шабурников, Шабурнов — образованы от тех же корней, но с другими суффиксами.

В ономастических работах фамилия Шабурдин не фигурирует как дворянская или старинная родовая. Она относится к поздним крестьянским и мещанским фамилиям, которые окончательно закрепились в XIX веке после отмены крепостного права, когда бывшим крепостным массово давали фамилии по прозвищам. Встречается преимущественно в Вологодской, Архангельской и Кировской областях — зонах бытования севернорусских говоров, где слово «шабурда» было в ходу.

Есть и вторая, менее вероятная версия: от диалектного «шабур» — вид верхней одежды, грубый кафтан или мешок. В этом случае Шабурдин — потомок портного, изготавливавшего такую одежду, или человека, носившего прозвище по предмету гардероба. Но первое объяснение — через характер — более логично, так как прозвища по поведению давали чаще, чем по одежде.