Фамилия Шабушева образована от мужского прозвища Шабуш, в основе которого лежит диалектный глагол «шабушить». В южнорусских и украинских говорах это слово означает «шуметь, возиться, поднимать суету», а также «говорить вздор, пустословить». Соответственно, Шабушем могли прозвать неспокойного, суетливого человека или болтуна. Такая модель — прозвище по характеру поведения — очень распространена в русской антропонимии.

Фамилия стоит в ряду однокоренных: Шабунин, Шабуров, Шабулин. Все они восходят к одному и тому же корню с чередованием суффиксов. Интересно, что в некоторых говорах «шабуша» означала также «оборванец» или «неряха», поэтому нельзя исключать и версию о прозвище по внешнему виду — неопрятном или бедно одетом человеке. Однако основное значение, связанное с шумом и беспокойством, фиксируется чаще.

Суффикс «-ев» указывает на принадлежность: Шабушев — это «сын Шабуша», «из рода Шабуша». Такие фамилии на «-ев» (после мягких и шипящих согласных) типичны для центральных и северных областей России. Географически фамилия Шабушева встречается в основном в Поволжье и на Урале, что подтверждается данными современных телефонных справочников и архивов.

Сословная принадлежность первых носителей не зафиксирована в открытых источниках, но судя по типу образования, это крестьянская или мещанская фамилия. Дворянские роды с таким окончанием редки, а прозвища по бытовым чертам характера — признак простонародной среды. Фамилия не входит в списки старинных боярских или княжеских родов.

Спорных версий происхождения немного. Иногда пытаются связать Шабушева с тюркским «шабу» (набег, атака), но это натяжка: русский глагол «шабушить» имеет славянскую природу (от звукоподражания «шаб» — шум, топот). Тюркское влияние в данном случае маловероятно, так как фамилия бытует в регионах, где славянская лексика преобладает.