Фамилия Шабышев — редкая и неоднозначная по происхождению. В её основе, скорее всего, лежит прозвище или имя, которое в русской среде переделали на свой лад, приспособив под привычную модель фамилий на -ев. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Шабышев значит «сын Шабыша» или «человек из рода Шабыша». А вот что такое «Шабыш» — главный вопрос.

Первая и самая правдоподобная версия связывает фамилию с тюркскими корнями. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) есть слово «шабыш» или «шабыс», которое может означать «бег», «скачка», «бегун» или «быстрый, резвый». Прозвище Шабыш могли дать человеку проворному, быстрому в работе или в передвижении. Учитывая, что в Поволжье и Приуралье русские фамилии часто возникали при активном смешении с тюркским населением, эта версия — рабочая. Если предок был крещёным татарином или башкиром, его тюркское прозвище легко русифицировали, добавив суффикс -ев.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая, — происхождение от православного имени. В народной речи имя «Савелий» иногда сокращали до «Савка», «Сава», а в некоторых говорах — до «Шавка» или «Шабыш». Такое фонетическое искажение (замена «с» на «ш») характерно для некоторых северных и вологодских говоров. Тогда Шабышев — это «сын Савелия». Однако эта версия слабее, потому что для имени Савелий есть более устойчивые уменьшительные формы, а «Шабыш» для него — редкая и спорная трансформация.

Географически фамилия встречается нечасто, но заметна в Татарстане, Башкирии, Оренбургской и Самарской областях. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: ареал бытования фамилии совпадает с зоной активных русско-тюркских контактов. В старых документах фамилию могли писать по-разному: Шабышев, Шабышов, Шабишев — из-за нестабильности гласной в корне.

Сословная принадлежность предков Шабышевых, скорее всего, была крестьянской или мещанской. В дворянские родословные книги эта фамилия не попала. Ничего не известно и о ярких исторических личностях с этой фамилией — она осталась в тени, бытуя в основном в среде сельских жителей и горожан небольших городов. Таким образом, Шабышев — это фамилия-загадка с тюркским привкусом, которую носили потомки быстрого, шустрого человека по прозвищу Шабыш.