Фамилия Шарышев образована от прозвища Шарыш. В её основе лежит диалектное слово «шарыш», которое в разных русских говорах имело два основных значения: «плут, пройдоха, ловкач» и «неряха, растрёпа». В словаре Владимира Даля зафиксирован глагол «шарыжничать» — промышлять плутовством, а также существительное «шарыжник» — мошенник. Таким образом, прозвище Шарыш могло закрепиться либо за человеком хитрым и изворотливым, либо, наоборот, за небрежным в одежде и внешности.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ев присоединился к основе на шипящую. Фамилия Шарышев — это краткое притяжательное прилагательное, отвечавшее на вопрос «чей?»: сын Шарыша. Поскольку прозвища давали не детям, а взрослым, первым носителем фамилии был, скорее всего, человек, которого в округе знали как Шарыша.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южнорусским областям. Встречается в архивных записях XVII–XVIII веков по Тульской, Рязанской и Воронежской губерниям. В этих краях слово «шарыш» бытовало именно в значении «плут» — прозвище, которое могли дать не в осуждение, а с оттенком уважительной иронии: ловкий, себе на уме человек.

Стоит отметить, что существует редкая версия о связи фамилии с тюркским корнем «шар» — «левый, неверный». Однако она слабо подтверждена: русские фамилии на -шев обычно имеют славянскую основу, а тюркские заимствования в этом суффиксальном типе единичны. Намного вероятнее, что Шарышев — чисто русская фамилия, возникшая из живого народного прозвища.