Фамилия Шадуров чаще всего происходит от прозвища Шадур, которое, в свою очередь, восходит к тюркскому корню «шадыр» — «шатёр», «палатка», «навес». В русских говорах слово «шадур» или «шадыр» фиксировалось в значении «шалаш», «временное жильё». Таким образом, прозвище мог получить человек, живший в шалаше, либо тот, кто торговал в палатке, либо бедняк, не имевший постоянного дома. В тюркских языках есть и другое значение: «шадир» — «радостный», «весёлый», так что не исключён и вариант прозвища по характеру.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: к основе на твёрдый согласный прибавили суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей сын?» — Шадуров). Фамилия закрепилась на территории бывшего Казанского ханства и в смежных областях — в Татарстане, Башкортостане, Оренбуржье, а также в южнорусских регионах, где было сильное тюркское влияние. Встречается и вариант Шадыров, что подтверждает исходную форму.

Менее распространённая версия связывает фамилию с арабским именем Шадур, но это имя не входит в число распространённых мусульманских имён, поэтому тюркское прозвищное происхождение выглядит надёжнее.

Социальный статус первых носителей, скорее всего, был невысоким: прозвище от «шатра» или «шалаша» указывает на крестьян или ремесленников, живших в лёгких постройках. В дворянских родословных книгах фамилия Шадуров не значится, что косвенно подтверждает её простонародное происхождение.