Фамилия Шадыханова — женская форма фамилии Шадыханов, и её происхождение ведёт нас в тюркскую языковую среду. Основа фамилии — сложное имя или прозвище «Шады-хан», где первая часть восходит к тюркскому «шады» или «шад» — титул, обозначавший князя, наместника или военачальника у древних тюрок (огузов, кыпчаков). Вторая часть, «хан», — всем известный верховный титул правителя. Таким образом, имя Шады-хан могло означать «князь-правитель» или «хан, достойный княжеского титула», и давалось как почётное именование, а не обязательно указывало на реальное обладание властью.

Суффикс «-ов» в мужской форме Шадыханов указывает на русскую модель образования фамилий — от имени отца. То есть Шадыхановы — это потомки человека по имени Шады-хан. Фамилия характерна для народов Северного Кавказа и Поволжья, особенно распространена среди кумыков, ногайцев и татар. В русских документах такие фамилии закрепились в XIX веке, когда у тюркских народов начали массово фиксировать фамилии по отцовской линии.

Редкость фамилии в том, что основа «Шады» не так часто встречается в современных тюркских именах; она архаична и восходит к древнетюркской титулатуре, что делает фамилию своеобразным лингвистическим артефактом. В отличие от более массовых фамилий на «-ханов» (например, Алиханов, Магомедханов), вариант Шадыханов сохранил исторический титул, вышедший из обихода. Носительница такой фамилии может с высокой вероятностью проследить корни в среде тюркской знати или военной аристократии, хотя со временем фамилия стала просто родовым именем без сословной окраски.