Фамилия Шафронская — вариант женского рода от мужской фамилии Шафронский. С точки зрения словообразования, это типичная «географическая» фамилия: суффикс -ск- указывает на связь с местностью или владением. Такие фамилии чаще всего получали дворяне по названию своего поместья, а также выходцы из духовного сословия, которым давали фамилии по названию села или церковного прихода.

Основа фамилии — топоним Шафроны или Шафроново. Такие названия встречаются в западных и южных регионах бывшей Речи Посполитой и Российской империи. В основе названия, скорее всего, лежит имя собственное Шафрон. Это форма крестильного имени Софроний (от греческого «софронос» — благоразумный, здравомыслящий), переделанная в просторечии: Софрон → Шафрон. Подобная замена начального «с» на «ш» характерна для украинских и белорусских говоров, а также для южнорусских диалектов.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с профессиональным прозвищем. В некоторых говорах «шафраном» называли не только пряность, но и красильщика, работавшего с жёлтым пигментом. Однако в этом случае фамилия скорее имела бы форму Шафранов или Шафранников, а не Шафронский. Поэтому версия с личным именем Софроний выглядит убедительнее.

Поскольку фамилия заканчивается на -ская, её носительницы в прошлом, скорее всего, принадлежали либо к мелкопоместному дворянству (владельцы деревни Шафроны), либо к духовенству. В среде священников фамилии на -ский часто давали выпускникам семинарий по названию родного села. В любом случае, Шафронская — фамилия не массовая, а локальная, привязанная к конкретной местности в западной части России или на Украине.