Фамилия Шагапова происходит от восточного мужского имени Шагап, которое, вероятно, образовано от двух слов: «шах» («повелитель») и «габбас» («строгий, суровый, угрюмый»). По другой версии, фамилия Шагапова связана с названием расположенного близ Арарата армянского города Шагап, выходцем из которого мог быть предок Шагаповых. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Шагаповых можно лишь на основании генеалогических исследований.