Фамилия Шагниязов — один из тех редких случаев, когда русская фамилия образована не от славянского корня, а от тюркского личного имени. Её основа — мужское имя Шагнияз, которое бытовало у татар, башкир и других тюркских народов Поволжья и Средней Азии. Имя составное: первая часть «шаг» (от персидского «шах» — царь, владыка) и вторая «нияз» (от арабского «нияз» — нужда, просьба, дар). В целом имя Шагнияз можно перевести как «царский дар» или «дар владыки». Фамилия, таким образом, означает «потомок Шагнияза».

Модель образования типична для русифицированных тюркских фамилий. К основе Шагнияз добавлен русский патронимический суффикс -ов, который в данном случае адаптирован к произношению: после мягкого «з» появляется соединительный гласный, и мы видим не «Шагниязов», а именно «Шагниязов» (на письме это закреплено как -ев). В исконной тюркской среде фамилия могла бы звучать как Шагниязов, Шагниязов-улы или вовсе без суффикса.

Наиболее вероятная среда возникновения — татарские или башкирские семьи, которые в XIX–XX веках, при получении паспортов или переписях, получили фамилию по имени отца. Поскольку имя Шагнияз не было массовым (оно встречается реже, чем, скажем, Шайхелислам или Нияз), фамилия Шагниязов остаётся локальной и немногочисленной. Встречается преимущественно в Татарстане, Башкортостане, а также в среде татарской диаспоры в других регионах России.

С точки зрения социальной истории, предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, а не аристократией — составные имена с компонентом «шах» в народной среде часто давали как пожелание удачи и достатка, а не как указание на реальный высокий статус. Встречается вариант написания Шагниязов, но он редок и, вероятно, является результатом ошибки в документах при унификации фамилий.