Фамилия Шакис — редкая для русского языкового пространства, и её происхождение лежит не в славянской, а в балтийской или греческой традиции. В отличие от типичных русских фамилий на -ов, -ин или -ский, суффикс -ис указывает на литовскую или латышскую модель образования. В Литве и Латвии такие фамилии массово формировались в XVIII–XIX веках, часто от прозвищ, имён или названий профессий. Поэтому первое, что стоит предположить: Шакис — это литуанизированная или латышизированная форма, и её носитель, скорее всего, имел предков из Прибалтики.

Основа фамилии — «шак-» — может восходить к литовскому šakà («ветвь») или šaknis («корень»). В таком случае прозвище Шакис давали человеку с коренастой фигурой, широкими плечами или, в переносном смысле, тому, кто был «корнем» рода, основателем семьи. Есть и другая, менее вероятная версия: от литовского šakė («вилы») — прозвище мог получить крестьянин, работавший с сеном, или человек с характерной внешностью (например, с кривыми ногами). В греческом языке существует фамилия Σάκης (Сакис), но она образуется от имени Сакис (краткая форма от Афанасиос) и пишется через сигму, а не через «ш». Для фамилии Шакис греческое происхождение маловероятно, если только не было искажения при записи в документах.

С точки зрения географии, фамилия Шакис встречается в основном на северо-западе России — в Ленинградской, Псковской областях, а также в Калининградской области и, конечно, в Литве и Латвии. В XIX веке, после присоединения Прибалтики к Российской империи, балтийские фамилии нередко русифицировались: к ним добавляли русские окончания (Шакисов, Шакисский), но форма Шакис сохранилась в исходном виде, что говорит о поздней фиксации или о том, что носители оставались в среде, где литовский или латышский язык был основным.

Сословная принадлежность предков Шакис, скорее всего, была крестьянской или мещанской. В Литве и Латвии фамилии на -ис в основном носили свободные крестьяне и горожане, а не дворяне (у которых были фамилии на -ич, -ский или польские окончания). Таким образом, если вы встретили фамилию Шакис, её обладатель, вероятно, потомок прибалтийского крестьянина или ремесленника, чьё прозвище было связано с природой или бытом — «веткой», «корнем» или «вилами».