Фамилия Шаковская — редкий случай, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает прозвищное. Она принадлежит к типично дворянской модели на -ский/-ская, которая в XVI–XVII веках закреплялась за выходцами из конкретных мест. В основе почти наверняка лежит топоним — название села или усадьбы вроде Шаково, Шаковка или Шаков. Такие названия встречаются в Смоленской, Тверской и Псковской областях, и именно оттуда, скорее всего, пошёл род Шаковских.

Мужской вариант — Шаковский. Окончание -ская указывает на женскую форму или, реже, на то, что фамилия закрепилась за семьёй в неизменном виде (как у дворянок, которых в документах писали сразу по мужу). Если копнуть глубже, основа «Шак» могла произойти от прозвища Шак — в русских говорах так называли крикуна, горлопана или задиру. Но для фамилии с суффиксом -овский/-евский прозвищная версия слабее: такие фамилии почти всегда «географические», а не «характерные». Более вероятно, что само село получило имя от человека по прозвищу Шак, а уже жители стали Шаковскими.

В дореволюционных источниках фамилия встречается нечасто. Шаковские — это, как правило, мелкопоместные дворяне, владевшие землёй в западных губерниях, или выходцы из духовного сословия (семинаристы часто брали фамилии по названию родного села). Встречается и написание через «о» — Шоковская, но это уже локальный диалектный вариант. В современной России фамилия редкая, сосредоточена в основном в центральных и северо-западных регионах.

Если ваш предок — Шаковский, то, скорее всего, его корни уходят в небольшую деревню, где жили крестьяне или однодворцы, получившие фамилию по месту жительства. Родового герба у Шаковских нет — в «Общий гербовник» эта фамилия не внесена, что типично для нетитулованного дворянства или поздних приписных сословий.