Фамилия Шалагур — редкий случай, когда прозвищная основа сохранилась почти без изменений, не «причесанная» стандартными суффиксами -ов или -ин. В ней нет окончания, типичного для русских фамилий, что сразу выдает ее происхождение: это «окаменевшее» прозвище, закрепившееся в той форме, в какой его дали первому носителю. Такое оформление чаще встречается на западе и юге России, в украинских и белорусских землях, где фамилии на -ук, -юк, -ич или вовсе без суффикса — обычное дело.

Корень слова — «шалаг» или «шалага». В южнорусских и украинских говорах «шалага» — это невысокий, худощавый человек, иногда с оттенком пренебрежения: нечто вроде «заморыша» или «недоростка». В. И. Даль фиксирует «шалага» как «неуклюжий, долговязый парень», а в некоторых диалектах — «шалапай», «шалапут», то есть человек несерьезный, ветреный. Вторая часть фамилии — «-ур» — может быть суффиксом, характерным для украинских и польских прозвищ (сравните: Халабуда — Халабура, Мазур), либо искажением более длинного слова. Есть версия, что «шалагур» — это вариант «шалагура», то есть «шалого» (бестолкового, шального) человека, но она менее состоятельна: корень «шал-» дает другие формы.

География фамилии узкая. Шалагур — фамилия, распространенная в основном на Западной Украине (Волынь, Ровенская область) и в прилегающих районах Беларуси. Встречается и в Польше, что подтверждает западнославянский след. Это подсказывает, что предки носителей фамилии были крестьянами или мелкими ремесленниками — прозвища такого типа редко давали людям знатного сословия. В документах XIX века, например, в метрических книгах Волынской губернии, фамилия Шалагур фиксируется как наследственная, без изменений по падежам.

Словообразовательная модель проста: прозвище Шалагур (человек, которого за внешность или характер прозвали «шалагой» или «шалагуром») перешло в фамилию без дополнительных суффиксов. Это отличает её от более распространенных Шалагуровых, где суффикс -ов «обрусел» фамилию, привязав её к модели «чей сын?». Шалагур — более архаичная, диалектная форма, сохранившая живую речь тех, кто давал прозвища.

Если искать аналогии, то в том же ряду стоят фамилии Шалабода, Шалапута, Шалаев. Все они образованы от прозвищ, описывающих человека через его внешность или поведение, и несут отпечаток местного говора. Фамилия Шалагур — не «испорченное» заимствование, а местное, народное имя, которое носили люди, жившие на границе славянских диалектов.