Фамилия Шаланин образована по очень распространённой на Русском Севере модели: суффикс -ин указывает на принадлежность «сын такого-то» или «человек из семьи такого-то». Основа здесь — личное имя или прозвище Шалана. Это уменьшительная форма от крестильного имени Шалай, которое, в свою очередь, является народным вариантом канонического имени Сила (от лат. Silvanus — «лесной») или, реже, Селиван. На Севере и в Сибири имя Шалай, Шалана было вполне обычным, и фамилии на -ин от него — Шаланин, Шалаев — встречаются в Вологодской, Архангельской, Кировской областях.

Другая версия, менее вероятная, связывает основу с диалектным словом «шалана» — так в некоторых говорах называли рыбацкую сеть или, по другим данным, нерасторопного, медлительного человека. Но если бы фамилия происходила напрямую от прозвища по занятию (рыбак), она скорее приняла бы форму Шаланов или Шаланкин. Форма на -ин почти всегда отталкивается от личного имени, так что первая версия надёжнее.

Интересная деталь: в документах XVIII–XIX веков фамилия Шаланин устойчиво фиксируется среди государственных крестьян и мещан северных уездов. Это значит, что предки носителей фамилии не были крепостными, а жили на казённых землях, занимались земледелием, промыслами и торговлей. Встречается фамилия и у старообрядцев — в среде поморов и кержаков, где имя Шалай было особенно популярно из-за своей «простонародности» и отсутствия связи с официальной церковью.

Таким образом, Шаланин — это типичная севернорусская фамилия, в основе которой лежит не прозвище, а личное имя Шалана. Человек с такой фамилией с большой вероятностью имеет предков из Вологодчины, Архангельской губернии или Вятки, и эти предки были свободными крестьянами или посадскими людьми.