Фамилия Шалдиков образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: от прозвища или имени через суффикс -ов. Суффикс -ов указывает на принадлежность, то есть «Шалдиков» буквально означает «сын Шалдика» или «человек из семьи Шалдика». Основа здесь — Шалдик, а она, в свою очередь, восходит к более древнему имени или прозвищу.

Корень «шалд-» в русских говорах имеет несколько значений, и понять, какое из них стало основой фамилии, можно только с оглядкой на регион. В архангельских и вологодских говорах «шалда» — это бестолковый, пустой человек, болтун. В сибирских диалектах тем же словом называли шалуна, проказника. Есть и менее распространённое значение — «шалда» как плохая, жидкая похлёбка, но прозвища по еде обычно давали поварам или любителям поесть, так что эта версия тоже возможна, хоть и реже.

Вероятнее всего, фамилия Шалдиков возникла в северных или центральных губерниях России, где диалектное слово «шалда» было в ходу. Прозвище Шалдик могли дать человеку с живым, непоседливым характером или, наоборот, тому, кого считали пустомелей. В любом случае, это прозвищное имя, а не крестильное, то есть предок носителя фамилии получил её не по церковному календарю, а по бытовой черте.

Встречается фамилия и в варианте Шалдыков — с буквой «ы» в корне. Это не ошибка, а фонетическое колебание, характерное для некоторых южнорусских говоров, где «и» после твёрдых согласных звучит как «ы». Обе формы, Шалдиков и Шалдыков, восходят к одному прозвищу и считаются однокоренными, хотя в документах они могут записываться по-разному.

Среди однокоренных фамилий — Шалдин, Шалдов, Шалдунов. Все они образованы от того же корня, но с разными суффиксами: -ин, -ов, -ун. Фамилия Шалдиков — одна из самых прозрачных по словообразованию, но не самая частотная, что говорит о её локальном происхождении: скорее всего, она закрепилась в одной или нескольких смежных губерниях и не получила широкого распространения по всей России.