Фамилия Шалигин — одна из тех, что ставит перед исследователем загадку: основа настолько редкая, что её приходится буквально собирать по крупицам. Словообразовательная модель прозрачна: суффикс -ин указывает на происхождение от прозвища или имени, оканчивающегося на -а/-я. То есть Шалигин — это «сын Шалиги» или «человек из рода Шалиги». Но вот откуда взялось само слово «Шалига»?

Самая вероятная версия ведёт к диалектному глаголу «шалить» — в старорусском языке это значило не только «баловаться», но и «проказничать, озорничать, делать что-то не по правилам». Прозвище Шалига могли дать человеку непоседливому, склонному к шалостям или даже к мелкому хулиганству. В некоторых говорах «шалига» означала ещё и «плут», «обманщик» — оттенок мог быть как шутливым, так и осуждающим. Такой тип прозвищ по характеру — один из самых распространённых в русской ономастике, и Шалигин вписывается в этот ряд.

Менее очевидная, но не менее интересная гипотеза — связь с ремеслом. В северных и сибирских говорах словом «шалига» могли называть особый вид лодки или челнока (сравните с «шаланда»). Если это так, то Шалигин — потомок лодочника, рыбака или перевозчика. Однако эта версия менее надёжна: слово «шалига» в значении «лодка» фиксируется редко и локально, тогда как глагольная основа «шал-» встречается повсеместно.

По географии фамилия Шалигин не образует плотных гнёзд — это довольно редкая фамилия. Её можно встретить в центральных областях России (Тверская, Московская губернии) и на Урале, что типично для фамилий, возникших из прозвищ: они редко привязываются к одному региону. В дворянских родословных книгах Шалигины не значатся — скорее всего, это фамилия крестьянская или мещанская, образованная в XV–XVII веках, когда прозвища окончательно закреплялись за родами.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Шалимов, Шалин, Шалый — подтверждает, что корень «шал-» был активен в прозвищной традиции. Шалигин стоит несколько особняком из-за редкого суффиксального оформления: не -ов/-ев и не -ин от краткого прилагательного, а -ин от существительного на -а. Это делает фамилию более архаичной по форме — такие модели чаще встречаются в северо-западных землях бывшей Новгородской республики.

Итог: Шалигин — фамилия от прозвища, скорее всего, характеризующего человека по поведению. Точное значение утрачено вместе с диалектами, но «шалун» или «озорник» — наиболее вероятный первоначальный смысл. Никакой тайны дворянского происхождения или иностранных корней здесь нет, и это нормально: большинство русских фамилий родилось из таких вот бытовых, живых прозвищ.