Фамилия Шапигин образована по самой распространённой в русском языке модели — от прозвища или имени с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Шапигин, то есть сын или потомок Шапиги. Основа здесь — слово «шапига» или «шапыга». В русских говорах, особенно северных и сибирских, «шапыгой» называли нечто шаткое, неуклюжее, а также человека с неровной, «шаткой» походкой. В словаре Владимира Даля «шапыгать» означает «ковылять», «идти вперевалку» или «делать что-то небрежно, шиворот-навыворот». Таким образом, первым носителем прозвища Шапига мог быть человек с характерной походкой — тот, кто прихрамывал, косолапил или просто ходил размашисто, неуклюже.

Вторая, менее очевидная версия отталкивается от диалектного слова «шапка» в значении «покрышка», «верхушка». В некоторых говорах «шапигой» называли верхний сноп в стоге или накидку, колпак. Тогда прозвище могло достаться крестьянину, который укладывал скирды, или же мастеру, делавшему шапки, колпаки. Однако эта версия слабее: глагольная основа «шапыгать» встречается гораздо чаще и даёт более живую, бытовую характеристику человека.

Фамилия Шапигин — относительно редкая. Она не попала в списки московского дворянства или распространённых купеческих родов, что типично для прозвищных фамилий крестьянского и посадского населения. Географически её корни, скорее всего, лежат в северных и центральных губерниях России — Архангельской, Вологодской, Вятской, где диалект «шапыгать» был в ходу. Обратите внимание на однокоренные фамилии: Шапин, Шапкин, Шапошников — они все от разных значений слова «шапка», а вот Шапигин стоит особняком, указывая не на предмет одежды, а на манеру движения.

В написании фамилия устойчива: вариант «Шапегин» (через «е») встречается, но реже и, вероятно, является результатом «акающего» произношения, когда безударная «и» звучит как нечто среднее. Современные носители фамилии Шапигин рассеяны по всей России, но чаще всего встречаются в Поволжье и на Урале, что подтверждает миграцию северного крестьянства в XVIII–XIX веках.