Скорее всего, фамилия Шалкин образована от топонима Шалково. Вероятно, основатель рода Шалкиных родился в Польше в местечке Szałkowo. Существует также версия, что данная фамилия восходит к прозвищу Шалка, которое связано с чешским shalek или польским szala, которые имеют один и тот же перевод — «чашка». В таком случае фамилию Шалкин мог получить мастер по изготовлению чашек и другой посуды. Тогда она относится к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности человека. Наконец, нельзя исключать версию, согласно которой, эта фамилия ведет свое начало от сербского слова «шала» — «шутка». Поэтому основатель рода Шалкиных мог быть веселым, жизнерадостным человеком, острословом.