Фамилия Шалтина — женская форма фамилии Шалтин. В русской традиции фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а или -я, поэтому исходная мужская фамилия звучит как Шалтин. Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын или потомок Шалты). Сама основа, скорее всего, восходит к прозвищу или неканоническому имени Шалта.

Что могло значить это прозвище? Самый вероятный корень — диалектный глагол «шалтать» или «шалтыгать», означавший «шататься, болтаться, качаться». В говорах северных и центральных областей России так говорили о неуклюжем, вертлявом человеке или о том, кто ходит вразвалку. Реже встречается значение «шалопай, бездельник» — отсюда же и слово «шалтай-болтай». Таким образом, Шалтой могли прозвать либо человека с характерной походкой, либо непоседу.

Менее распространённая версия связывает фамилию с тюркскими языками, где «шалта» могло означать «быстрый, резвый». Однако для фамилий, бытующих в основном в русскоязычной среде, славянская диалектная основа выглядит убедительнее. Важно и то, что фамилия Шалтин встречается редко и не имеет массового распространения в каком-либо одном регионе — это указывает на её происхождение от локального прозвища, а не от распространённого крестильного имени.

Фамилия Шалтина не документирована в дворянских родословных книгах, что типично для крестьянских и мещанских фамилий. Её носители, скорее всего, происходят из среды сельских жителей или посадских людей, а сама фамилия закрепилась за потомками человека с прозвищем Шалта где-то в XVII–XIX веках.