Фамилия Шампаньер — редкий случай, когда русская по форме фамилия имеет очевидное французское происхождение, но при этом почти наверняка не связана с благородными эмигрантами или виноделами. Скорее всего, перед нами пример «кабинетной» или «семинарской» фамилии, которую давали в духовных училищах России в XVIII–XIX веках.

Основа фамилии — французское слово «champagne» (шампанское) или «champagnier» (тот, кто имеет отношение к Шампани; в переносном смысле — винодел, торговец шампанским). Суффикс -ер (фр. -ier) в русской передаче — типичный для обозначения профессии или места жительства. Однако в крестьянской среде, где фамилии часто образовывались от прозвищ по занятию, «Шампаньер» почти не встречается: шампанское было недоступно простому народу, а контакты с французскими виноделами — редкость.

Главная версия происхождения — искусственное образование в среде русского духовенства. В семинариях будущим священникам нередко давали «благозвучные» фамилии на иностранный манер, часто от названий вин, цветов, драгоценных камней или географических названий. Шампаньер мог получить ученик, которого отличала жизнерадостность, любовь к праздникам или — что ещё более прозаично — просто красивая, «французская» фамилия, выделявшая его среди Ивановых и Петровых. Подобные фамилии встречаются и у однокоренных: Шампанский, Шампанцев, Шампань.

Вторая, менее вероятная версия — потомок французского мастера-винодела или ремесленника, выписанного в Россию в XVIII веке. Такие специалисты работали в имениях знати, но их фамилии обычно не русифицировались суффиксом -ер, а сохраняли французское окончание (например, Шампанье). Форма Шампаньер с твёрдым -ер — признак адаптации через русское произношение, что характерно именно для семинарской среды.

Географически фамилия редкая, встречается точечно в центральных губерниях России (Тверская, Ярославская, Московская), где были сильны духовные училища. В дворянских родословных книгах она не зафиксирована, что косвенно подтверждает её «семинарский» след.

Таким образом, Шампаньер — не указание на профессию предка, а скорее «учёное» прозвище, данное в стенах бурсы. Носитель такой фамилии мог быть сыном дьячка или священника, получившим звучное имя, отсылающее к французскому шику, но без реального отношения к Франции.