Фамилия Шампанина звучит нестандартно для русского уха — в ней слышен отзвук французского слова «champagne». Однако прямое происхождение от названия игристого вина маловероятно: фамилии в крестьянской среде редко образовывали от заимствованных понятий без бытовой или прозвищной основы. Скорее всего, корень здесь — искажённое или диалектное слово «шампан», которое в русских говорах могло означать нечто совсем другое, нежели провинцию во Франции.

Вероятнее всего, в основе лежит прозвище Шампан или Шампаня. В некоторых областях России «шампаном» называли хвастуна, любителя пустить пыль в глаза, либо, наоборот, неопрятного, неряшливого человека — слово могло быть переосмыслением «шантрапа» (сброд, никчёмный народ). Есть и другая версия: фамилия могла возникнуть от редкого имени или прозвища, связанного с глаголом «шампанить» — шуметь, буянить, вести себя развязно. Такая модель типична для русских фамилий: сначала уличное прозвище, потом фамилия на -ин, указывающая на принадлежность («чей?» — сын Шампаны).

Суффикс -ин — один из самых распространённых в русской антропонимии, он характерен для фамилий, образованных от слов женского или мужского рода на -а/-я. То есть Шампанина — это буквально «дочь (или жена) Шампаны». Форма женского рода закрепилась как основная, что бывает, если фамилия впервые записана за женщиной или в семье, где глава носил прозвище Шампана.

Географически фамилия редкая и встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, единично — на Урале. В дореволюционных метрических книгах её фиксировали в крестьянской среде, что исключает дворянское или купеческое происхождение. Никакой связи с французским виноделием, скорее всего, нет — это чисто русское прозвище, которое со временем обрело благозвучную, почти европейскую форму.