Фамилия Шапекин — довольно редкая, и её происхождение напрямую связано с профессиональным прозвищем. В основе лежит слово «шапка», но не в современном, а в старинном значении. В русских говорах «шапекой» или «шапегой» могли называть мастера, который валял шапки, или же просто торговца головными уборами. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был скорняком или ремесленником, изготавливавшим шапки.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Шапекин — это «сын Шапеки». Такой способ образования типичен для русских фамилий от прозвищ или профессий, оканчивающихся на -а или -я. Если бы основа была на согласный, мы бы увидели суффикс -ов (как в фамилии Шапкин, которая встречается чаще). Разница в суффиксе — важная деталь: Шапекин образована от прозвища «Шапека», а не напрямую от слова «шапка».

Стоит упомянуть и менее вероятную, но возможную версию. В некоторых диалектах «шапекой» называли не шапку, а ленивого или нерасторопного человека (от глагола «шапать» — шаркать, идти медленно). Однако эта гипотеза слабее: профессия всегда даёт более устойчивое и распространённое прозвище, чем случайная черта характера. К тому же, однокоренные фамилии вроде Шаповалов, Шапочников, Шапкин уверенно отсылают к ремеслу.

Географически фамилия Шапекин не привязана к какому-то одному региону, но встречается в центральных областях России и в Поволжье. В дореволюционных переписях её носители чаще всего оказывались крестьянами или мещанами — людьми, чьё прозвище закрепилось за родом именно в среде ремесленников.

В отличие от более «гладкой» фамилии Шапкин, Шапекин сохранила в основе уменьшительно-пренебрежительный оттенок (суффикс -ек-), что характерно для живой разговорной речи. Так мастеров или торговцев шапками в быту называли не по фамилии, а по прозвищу — Шапека, то есть «шапочник», и уже от этого прозвища пошла фамилия.