Фамилия Шапоткина — женская форма фамилии Шапоткин, и её разбор стоит начать с неочевидного суффикса. В русских фамилиях суффикс -кин обычно указывает на принадлежность: «чей?» — «Шапоткин» означает «сын Шапотки». Но основа «Шапотк-» встречается редко, и это сразу настораживает: почему не Шапотников, Шапкин или Шапошников?

Корень здесь — «шапотк-», который, скорее всего, связан с диалектным словом «шапотка» или «шапоток». В южнорусских и украинских говорах так называли небольшую шапку, шапочку, ушанку или просто головной убор. То есть фамилия образована от прозвища Шапотка — человека, который либо носил такую шапку, либо шил или продавал их. Суффикс -к- в основе уменьшительный, а значит, прозвище могло быть дано человеку невысокого роста или с характерной маленькой шапкой.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с глаголом «шапотать» (шептать, шушукаться), известным в некоторых диалектах. Тогда Шапотка — прозвище тихого, скрытного человека. Но это предположение слабее: фамилии на -отк- от глаголов редки, а «шапотка» как предмет одежды встречается в письменных источниках чаще.

Географически фамилия Шапоткин (и Шапоткина) тяготеет к югу России и востоку Украины. В переписях XIX века её фиксировали в Курской, Воронежской губерниях и в Области Войска Донского. Это объяснимо: именно в этих регионах слово «шапотка» было в ходу, в отличие от северных говоров, где говорили «шапчонка» или «шапка».

Сравнение с однокоренными фамилиями — Шапкин, Шаповалов, Шапошников — показывает, что Шапоткина стоит особняком. Если Шапкин прямо от «шапка», а Шаповалов от ремесла (валяльщик шапок), то Шапоткин — это уменьшительная форма с оттенком пренебрежительности или ласки. Предок носителя фамилии мог быть не просто шапочником, а мастером, делавшим недорогие или неказистые шапки, либо человеком, который сам носил такую шапку и получил за это прозвище.

Сословная принадлежность типична для крестьян и мещан: фамилия недворянская, образована от прозвища, а не от имени или топонима. В дворянских гербовниках она не значится.

Итог: фамилия Шапоткина происходит от прозвища или ремесла, связанного с головным убором — «шапоткой». Это редкий вариант более распространённых «шапочных» фамилий, сохранивший диалектную окраску.