Фамилия Шарафуддинов — яркий пример того, как русская модель фамилии на -ов наложилась на арабское по происхождению теофорное имя, то есть имя, содержащее указание на Бога. В основе лежит мужское личное имя Шарафуддин, которое с арабского переводится как «честь веры» или «достоинство религии» (шараф — «честь, достоинство», дин — «вера, религия»). Такие имена были особенно распространены в мусульманских культурах, и на Кавказе, в Поволжье и Средней Азии они встречаются до сих пор.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий, которые возникали у нерусских народов: к восточному имени добавлялся русский суффикс принадлежности -ов, образующий притяжательное прилагательное. Изначально Шарафуддинов — это «сын Шарафуддина», то есть потомок человека, носившего это имя. Фамилия закрепилась в тех регионах, где русская администрация фиксировала население по отчеству: в Татарстане, Башкортостане, у народов Дагестана и в среде среднеазиатских тюрков, входивших в состав Российской империи.

Интересно, что в отличие от фамилий на -ин, которые чаще встречаются у татар (например, Шарафутдинов), форма на -ов (Шарафуддинов) характерна для тех групп, где сильнее было влияние общерусской канцелярской традиции XIX века. Встречается и вариант Шарафутдинов — с заменой гласной «у» на «а» в середине имени, что связано с диалектным произношением или особым арабским написанием. Обе формы восходят к одному корню, но различаются огласовкой.

Социальный контекст тоже показателен: фамилии с основой «шараф» обычно носили не крестьяне, а люди, чьи предки имели отношение к исламскому образованию или духовенству, — муллы, учителя медресе, чтецы Корана. Имя Шарафуддин давали в семьях, где ценили учёность и благочестие, поэтому носитель фамилии с высокой вероятностью происходит из среды мусульманских религиозных деятелей или купечества, которое в Поволжье часто было связано с книжной традицией.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Шарафутдинов, Шарафуллин, Шарафетдинов — показывает, что все они образованы от одного арабского корня, но различаются региональными особенностями произношения и суффиксации. Фамилия Шарафуддинов встречается реже, чем Шарафутдинов, что может указывать на более локальное бытование — например, в среде крымских татар или у некоторых групп дагестанских народов.