Фамилия Шардыков образована от прозвища Шардык. Согласно одной из версий, это прозвище восходит к диалектному русскому слову «шарда», употреблявшемуся в пермских говорах. Шардой здесь называли один из рыболовных снарядов. Таким образом, основатель рода Шардыковых мог быть рыбаком. Согласно другой гипотезе, прозвище Шардык произошло от аналогичного топонима Сардык. Так называют горы, находящиеся в районе юга Сибири, граничащего с Монголией. Таким образом, можно предположить, что основатель рода был выходцем из мест близ гор Сардык. Эти горы получили свое название от обитавших в тех районах тюркоязычных племен Восточных Саянов. Саяны, смешавшись с другими тюркскими группами, вошли в состав тувинского народа. Этнически обитатели юга Сибири принадлежали к самодийским племенам. Название впервые появилось в записях русских путешественников, а впоследствии стало общеупотребительным. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шардык, со временем получил фамилию Шардыков.