Фамилия Шарфутова — женская форма фамилии Шарфутов, и её разбор стоит начать с неочевидного на первый взгляд корня. Вопреки возможной ассоциации с немецким словом «шарф» (платок), основа здесь тюркская. Фамилия образована от мужского имени Шарфут (или Шерфет), которое восходит к арабскому «шарф» — «честь, достоинство, благородство» с добавлением тюркского аффикса -ут, характерного для имён в татарской и башкирской среде. Таким образом, имя Шарфут буквально означало «почтенный», «обладающий честью».

Суффикс -ов в фамилии Шарфутов — классический русский патронимический показатель, присоединённый к тюркскому имени. Это типичная модель для фамилий, которые возникли в среде крещёных татар, мишарей или башкир в XVI–XIX веках, когда при переходе в православие или при ведении метрических книг инородные имена оформляли по русскому образцу: имя отца становилось фамилией сына. То есть носитель фамилии Шарфутов — потомок человека по имени Шарфут.

Географически фамилия Шарфутова встречается преимущественно в Поволжье и Приуралье: в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Это указывает на волго-уральское происхождение рода. Встречаются варианты написания с «ё» — Шарфутёва, но они редки и связаны с местными диалектными особенностями произношения.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий с тюркской основой, у Шарфутовых нет параллельной формы на -ин (как, например, у фамилий Шарифуллин или Шарафутдинов). Это говорит о том, что имя Шарфут бытовало как самостоятельное, а не как усечение от более длинного арабо-тюркского имени Шарафутдин («честь веры»). Социально предки Шарфутовых могли быть как крестьянами, так и служилыми татарами или торговцами — конкретных сведений о сословной принадлежности по одной фамилии без генеалогического исследования нет.