Фамилия Шартан — редкая и неочевидная. На первый взгляд её корень напоминает тюркские языки, где «шартан» может означать «сороконожка» или «многоногое существо», но вряд ли прозвище давали по насекомому. Вероятнее, что основа восходит к тюркскому «шарт» — условие, договор, либо к диалектному глаголу со значением «резать, кроить». В таком случае Шартаном могли прозвать человека, который заключал сделки, был посредником, или же портного, работавшего с кожей или тканью.

Словообразовательная модель указывает на то, что фамилия образована без типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский). Это характерно для прозвищ, которые перешли в фамилии в готовом виде, особенно на южных и восточных окраинах России, где сильны тюркские влияния. Подобные фамилии — Шартан, Чартан, Куртан — обычно фиксируются в казачьих областях, на Урале и в Сибири, куда переселенцы приносили прозвища из степных регионов.

Встречается и версия, связывающая фамилию с калмыцким или монгольским «шар» — жёлтый, и «тан» — тело, что в переносном смысле могло означать «светловолосый» или «рыжий». Однако это предположение менее надёжно, так как в русской среде прозвища по цвету волос обычно оформлялись через суффиксы (Рыжов, Белов), а не в виде голой основы.

География фамилии узкая. Основные носители встречаются в Оренбургской области, Башкортостане и Челябинской области. Это подтверждает связь с тюркскими народами Урало-Поволжья — башкирами, татарами, казахами. Возможно, предки Шартанов были скотоводами или торговцами, перегонявшими скот, и получили прозвище за умение договариваться о цене.

По сословной принадлежности фамилия не даёт точной информации. Шартаны могли быть государственными крестьянами, казаками или мещанами. Дворянских родов с такой фамилией в дореволюционных справочниках нет. Ономастические словари (например, работы Б. Унбегауна) обходят Шартан стороной, что лишний раз говорит о её локальном и нестандартном происхождении.