Фамилия Шавайдин — редкая, но прозрачная по своему происхождению. Она образована от восточного мужского имени Шавайди с помощью русского патронимического суффикса -ин, который отвечает на вопрос «чей?» и указывает на принадлежность: «сын Шавайди». В этом смысле фамилия типологически идентична массовым Иванову, Петрову или Сидорову, только с другой, нерусской основой.

Само имя Шавайди — сложное, тюркско-персидского происхождения. Первая часть «ша» (от персидского «шах») означает «царь», «господин», «владыка». Вторая часть восходит к арабскому корню «айд» — «рука», «сила», «мощь». В исламской ономастике имена с элементом «айд» передают идею божественной силы или могущества. Таким образом, Шавайди можно перевести как «царь силы» или «владыка могущества» — имя с выраженным пожелательным значением, которое родители давали сыну в надежде на его будущую силу и власть.

Вероятнее всего, фамилия Шавайдин закрепилась в среде тюркоязычных народов Поволжья или Приуралья — татар, башкир, чувашей — в период, когда у них начали массово появляться фамилии по русскому образцу (конец XIX — начало XX века). В метрических книгах и ревизских сказках того времени имя Шавайди могло записываться в разных вариантах: Шавайда, Шавайдин, Шавайдулла. Фамилия на -ин, а не на -ов, косвенно указывает на то, что в основе лежит имя, оканчивающееся на гласный или мягкий согласный, что для тюркских имён характерно.

Социально предки носителей фамилии Шавайдин, скорее всего, относились к крестьянскому или мещанскому сословию, реже — к духовенству (муллы и их дети тоже нередко получали фамилии от имён отцов). Никаких сведений о дворянских родах Шавайдиных в исторических документах не обнаружено — фамилия осталась в народной среде и сегодня встречается спорадически, преимущественно в Татарстане, Башкортостане и прилегающих областях.