Фамилия Шавлиев образована от имени или прозвища Шавли. В русской ономастике это редкий случай, когда основа не имеет очевидного славянского корня, а суффикс -ев указывает на патронимическое происхождение: «чей?» — Шавлиев, то есть потомок Шавли.

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркскими языками. Имя Шавли могло быть вариантом имени Шавкат (от арабского «сила», «могущество») или Шавлий (уменьшительная форма). В тюркской среде такие имена давали с пожеланием мальчику стать крепким, влиятельным. В пользу этой версии говорит и география: фамилия встречается в Татарстане, Башкортостане, а также у народов Северного Кавказа, где распространены основы на «шав-» (ср. Шавтиев, Шавлохов).

Менее убедительна гипотеза о связи с диалектным русским словом «шавлить» — болтать, пустословить. Словарь русских народных говоров фиксирует это слово в псковских и тверских говорах, но прозвище Шавля в таком случае означало бы «болтун» или «пустомеля». Однако подобные прозвища редко становились основой фамилий с суффиксом -ев, тем более что в тех же регионах фамилия Шавлиев почти не встречается.

Фамилия не относится к числу дворянских или старинных боярских — её нет в родословных книгах XVIII–XIX веков. Скорее всего, она оформилась в крестьянской или мещанской среде в XIX веке, когда патронимы стали фиксироваться как наследственные. Носители фамилии — люди, чей предок носил тюркское имя Шавли, что указывает на этнические или культурные контакты на южных и восточных рубежах России.