Фамилия Шайхеев — довольно редкий пример русской фамилии, образованной от арабского титула «шейх» (شيخ), что означает «старейшина», «предводитель», «мудрец» или «наставник». В исламской традиции шейхами называли уважаемых религиозных авторитетов, глав суфийских орденов или просто почтенных старцев. Слово попало в русский язык через тюркское посредничество, где оно звучало как «шайх» или «шейх».

Модель образования фамилии — притяжательный суффикс -ев, который присоединяли к основе, оканчивающейся на мягкий согласный или шипящий. В данном случае: Шайхей (тюркская диалектная форма от «шейх») + -ев. Буква «е» в середине фамилии — результат адаптации тюркского произношения: в русской записи «шайхей» звучало естественнее, чем «шайхий». Суффикс указывает на принадлежность: «чей?» — Шайхеев, то есть «сын Шайхея» или «потомок Шайхея».

Вероятнее всего, предок носителя фамилии был либо самим шейхом (духовным лицом), либо служил у такого человека, либо получил прозвище «Шайхей» за мудрость или почтенный возраст. В отличие от фамилий на -ов, образованных от чисто русских имен, эта фамилия почти не встречается в центральных областях России. Её география — Поволжье, Приуралье и Западная Сибирь, где исторически жили татары, башкиры и другие тюркские народы, принявшие ислам. В метрических книгах и переписях XIX века Шайхеевы чаще всего записаны среди мусульманского населения Казанской, Уфимской и Оренбургской губерний.

Интересно, что однокоренные фамилии — Шайхиев, Шейхов, Шейхетдинов — образованы от того же корня, но с разными суффиксами. У Шайхеева же заметна замена «и» на «е» во втором слоге, что указывает на конкретный тюркский диалект, где слово произносили как «шайхей». Это делает фамилию маркером определённой локальной группы, вероятно, казанских татар или мишарей.

Никаких документальных подтверждений принадлежности Шайхеевых к дворянству или купечеству нет — это типичная народная фамилия, закрепившаяся за крестьянами и мещанами. Сословного барьера она не имела: шейхами могли становиться выходцы из разных слоёв, если обладали знаниями и авторитетом.