Фамилия Шайхенуров — яркий пример восточного имени-прозвища, перешедшего в наследственный родовой знак. Её основа — составное арабское или персидское имя, распространённое среди тюркских и исламизированных народов (татары, башкиры, казахи). Первая часть, «шайх» (шейх), означает старейшину, духовного наставника или главу рода. Вторая часть, «нур», переводится как «свет», «сияние». Вместе «Шайхенур» — «свет шейха», «сияние старца» или, в переносном смысле, «тот, кто несёт свет веры». Это не прозвище по профессии, а скорее имя-благопожелание, которое давали в честь уважаемого религиозного деятеля или с надеждой на мудрость и духовную чистоту.

Русский суффикс -ов в конце указывает на то, что фамилия оформлена по русской модели притяжательных прилагательных: «чей?» — Шайхенуров, то есть сын или потомок Шайхенура. Такое окончание типично для фамилий народов Поволжья, Урала и Сибири, которые попали в сферу русского делопроизводства в XIX–XX веках. Чиновники или священники при переписях просто прибавляли к исходному имени стандартное русское окончание, и оно закреплялось.

В отличие от многих фамилий с корнем «шейх», здесь форма не «Шейхов» или «Шайхов», а именно с частицей «енур». Это редкий случай, когда второй компонент имени сохранился полностью, а не стянулся. Встречаются варианты написания через «а» (Шайхенуров) и через «е» (Шейхенуров), что связано с разной передачей арабского звука на письме и местными диалектами. Географически фамилия чаще всего фиксируется у татар и башкир, особенно в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане.

Формант -ов, а не -ин или -ский, говорит о том, что фамилия сложилась не в дворянской среде, а в среде крестьян, мещан или купцов, которых приписывали к фамилиям по отцу. Никакого особого сословного статуса она не несёт, кроме указания на то, что предок носителя, скорее всего, был человеком верующим или происходил из семьи, где почитали религиозных авторитетов.