Фамилия Шайхитдинов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Шайхитдинов уходит в XV-XVII вв. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Шайхитдинов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Фамилия Шайхитдинов ведет свое начало от мусульманского мужского имени Шайхитдин. Оно, как и большинство восточных имен, имеет сложную основу и происходит от слов «шайхи» и «дин». Первое из них переводится на русский язык как «старейшина, аксакал, руководитель, вождь», а второе — как «вера, религия». Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Шайхитдинов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Тем не менее, фамилия Шайхитдинов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.