Фамилия Шайхитов — один из тех случаев, когда в основе лежит не прозвище или ремесло, а титул. Корень «шайхит» восходит к арабскому «шейх» (شيخ) — «старейшина», «глава рода», «учитель», «духовный наставник». В тюркской среде, особенно у татар и башкир, это слово приобрело значение уважаемого человека, знатока ислама. Суффикс «-ит» в данном случае — это русифицированная форма арабского окончания относительного прилагательного «-ий» (шейхий — «относящийся к шейху»). По сути, Шайхит — это «тот, кто из рода шейха» или «потомок шейха».

Модель образования фамилии типична для тюрко-татарских фамилий, вошедших в русский обиход: к основе «Шайхит» добавили русский патронимический суффикс «-ов». Это указывает на то, что предок носителя фамилии, скорее всего, был человеком духовного или знатного происхождения. В татарской и башкирской среде фамилии на «-ов» от арабских титулов (как Абдуллин, Халитов, Саитов) были распространены среди мулл, муэдзинов и представителей мусульманского духовенства.

Географически фамилия Шайхитов наиболее характерна для Татарстана, Башкортостана, а также для Оренбургской и Челябинской областей, где исторически проживают тюркские народы. Встречается и у казахов, но в форме Шайхитов или Шайхит. Интересно, что в отличие от более массовой фамилии Шайхиев (от «шейх» напрямую), форма Шайхитов подчеркивает не просто принадлежность к статусу, а именно происхождение от конкретного человека по имени Шайхит или Шайхитдин.

Встречается также вариант написания с буквой «е» — Шейхитов. Эта разница может быть связана с диалектным произношением: в некоторых тюркских говорах звук «э» переходит в «а». Оба варианта считаются этимологически верными, но «Шайхитов» — более распространенная орфографическая норма в русских документах. Фамилия не относится к числу древних дворянских (в российском имперском смысле), но ее носители в дореволюционной России часто принадлежали к сословию «мулл» или «указных имамов», что давало определенные привилегии и освобождение от рекрутской повинности.