Фамилия Щафиков — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, что она значит, придётся разобрать её по частям и заглянуть в соседние языки.

Основа фамилии — «Щафик». Это, скорее всего, не славянское имя, а прозвище, пришедшее из тюркских языков. В татарском, башкирском или казахском языках есть слово «шафик» (или «шафыйк»), которое восходит к арабскому корню и означает «милостивый», «сострадательный», «жалостливый». Это одно из имён-эпитетов, которыми нарекали детей, желая им мягкого нрава или в знак благодарности за долгожданное рождение. В русской среде такое имя могло превратиться в прозвище, а затем и в фамилию.

Суффикс «-ов» указывает на стандартную русскую модель образования фамилий: «чей?» — «Щафиков», то есть «сын (или потомок) Щафика». Это типичный способ русификации нерусских имён и прозвищ. Фамилия могла возникнуть в среде крещёных татар, башкир или других тюркских народов, которые переходили в православие и получали фамилии по имени отца. В этом случае форма «Щафик» вместо «Шафик» — результат местного произношения (аканье, замена «ш» на «щ» в некоторых говорах) или особенностей записи в документах.

Вторая, менее вероятная версия — связь с диалектным русским словом «щаф» (или «щап»), которое означало щеголя, франта или хвастуна. В таком случае «Щафик» — уменьшительно-пренебрежительное прозвище от этого корня. Но эта гипотеза слабее, так как слово «щаф» встречается редко и не дало массовых фамилий, а тюркская основа «шафик» хорошо вписывается в ономастическую картину Поволжья и Приуралья, где такие фамилии не единичны.

Географически Щафиковы, скорее всего, родом из регионов с сильным тюркским влиянием: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская или Челябинская области. Там фамилии на «-ов» от мусульманских имён — обычное дело. Социально предки могли быть крестьянами или мещанами, поскольку фамилии по имени отца у непривилегированных сословий закрепились поздно, в XVIII–XIX веках. Дворянского корня у этой фамилии, скорее всего, нет.

Таким образом, фамилия Щафиков — это память о предке по имени Шафик (милостивый), которое через поколения и русскую грамматику превратилось в то, что мы видим сегодня.