Фамилия Щёчина — женская форма от мужской Щёчин, и её происхождение напрямую связано с прозвищем, а не с анатомией. Основа здесь — слово «щека», но не в прямом значении части лица. В русских говорах «щёкой» называли не только скулу, но и боковой выступ, отрог горы, крутой берег реки или клин земли. Человек мог получить прозвище Щека за выдающиеся скулы, за привычку надувать щёки, а мог — за то, что жил на мысу, на «щеке» реки. Судя по географическому распространению фамилии, второй вариант не менее вероятен: Щёчины встречаются в Вологодской, Архангельской и Кировской областях — там, где рельеф изобилует крутыми берегами и мысами.

Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность. Щёчин — буквально «сын Щеки» или «человек из рода Щеки». Форма Щёчина закрепилась как стандартная женская фамилия в XIX веке, когда в официальных документах жён и дочерей начали записывать по той же модели, что и мужчин, с окончанием -а. В крестьянской среде, особенно на Русском Севере, фамилии на -ин были типичны и часто образовывались от прозвищ без участия церковных имён.

Встречается и вариант написания через «е» — Щечина. Это не ошибка, а следствие двоякой передачи буквы «ё» в дореволюционных документах и паспортах советского времени. В метрических книгах XIX века одну и ту же семью могли записать и как Щечины, и как Щёчины — точка над «е» была делом писаря. Поэтому при поиске предков стоит проверять оба написания.

В ономастических справочниках фамилию Щёчин нередко связывают с диалектным словом «щёчка» — уменьшительным от «щека» в значении «деталь ткацкого станка» или «боковая планка». Если предок был ткачом или плотником, прозвище могло возникнуть по инструменту. Однако эта версия менее распространена: фиксаций фамилии в регионах традиционного ткачества (Иваново, Кострома) почти нет, тогда как на Севере она встречается регулярно.

Среди однокоренных фамилий — Щекин, Щекалов, Щекатуров. Все они восходят к тому же корню, но с разными суффиксами: -ин, -ов, -атур(а). Щёчина стоит в этом ряду как самая прямая по смыслу: без дополнительных наращений, просто «относящийся к Щеке».