Фамилия Щепухин звучит как нечто мелкое, колкое, почти бытовое — и это ощущение не обманывает. Её основа — слово «щепа» (щепка), а суффикс -ух- указывает на прозвище, образованное по характерному признаку. В русской ономастике суффикс -ух- (как в фамилиях Грязнухин, Лепёхин, Свистухин) часто придавал основе оттенок просторечности или пренебрежения: Щепуха — это не просто «щепка», а человек, которого так прозвали за худобу, угловатость или, возможно, за склонность к ссорам (сравните с диалектным «щепаться» — браниться, придираться). Фамилия закрепилась через патронимический суффикс -ин, то есть «сын Щепухи».

Вторая версия, менее очевидная, но правдоподобная: прозвище могло относиться к ремеслу. Щепой на Руси называли не только мелкие куски дерева, но и дранку, лучину, щепной товар — мелкие деревянные изделия (ложки, миски, игрушки). Щепухой могли прозвать мастера по щепной резьбе или того, кто торговал щепой. В некоторых говорах «щепуха» — это ещё и заноза, что опять же возвращает нас к внешней или поведенческой характеристике.

География фамилии показывает чёткую привязку к центральным и поволжским регионам России, особенно к Нижегородской, Костромской и Владимирской областям. Это зона активного развития деревянных промыслов, где прозвища по роду занятий с деревом были особенно распространены. Встречается фамилия и на Урале, куда переселенцы принесли её с собой в XVIII–XIX веках.

Словообразовательная модель Щепухин — редкий случай, когда основа не перешла в фамилию через стандартное отчество (Щепкин, Щепочкин), а сохранила уменьшительно-пренебрежительный суффикс. Это делает фамилию «живой»: она прямо указывает на то, как звали предка в быту, а не на его формальное имя или занятие. Если сравнивать с однокоренными, Щепухин стоит особняком — Щепетев, например, происходит от «щепет» (щегольство, мелочность), а Щепухин проще, грубее, ближе к деревенской речи.

В документах фамилия фиксируется с XVII века, но без громких исторических лиц. Носители Щепухиных — в основном крестьяне и мещане, что типично для фамилий на -ухин: они редко встречаются среди дворянства. Сегодня фамилия малочисленна, но устойчива — её не вытеснили более «благозвучные» варианты.