Фамилия Шебнов — один из тех случаев, когда внешне простая основа таит в себе несколько возможных объяснений. В первую очередь, это отчество, образованное от прозвища или имени Шебн(а) с помощью патронимического суффикса -ов. Суффикс указывает на «сына Шебна», то есть родоначальника фамилии звали именно так.

Корень «шеб-» в русских говорах имеет два ярких значения. В северных и сибирских диалектах «шебнуть» означало «ударить», «стегнуть», а «шебня» — драчливого, задиристого человека. В этом случае прозвище Шебна мог получить вспыльчивый или физически сильный предок. Вторая версия ведет к слову «шебень» (или «щебень») — мелкий камень, отходы при дроблении. В некоторых областях «шебной» называли человека, работающего с камнем, или того, кто живет на каменистой почве. Оба значения — прозвищные, а не крестильные.

Менее распространенная, но лингвистически возможная гипотеза — связь с тюркским «шеб» (ночь) или «шебан» (ночной сторож, пастух). В южнорусских и казачьих регионах такие корни оседали в фамилиях из-за контактов с татарским и башкирским населением. Однако для фамилии Шебнов эта версия слабее: тюркские заимствования обычно сохраняли более прозрачную форму (Шебанов, Шебалин), а форма Шебнов чаще выводится из русского диалектного слова.

С географической точки зрения фамилия встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда, но чаще фиксируется в Поволжье и на Урале — в зоне, где северорусские говоры смешивались с местными наречиями. Это косвенно подтверждает версию о диалектном происхождении, а не о тюркском заимствовании.

В написании фамилии нет спорных моментов: буква «ё» в корне не ставится, хотя при произношении ударение падает на первый слог — Шéбнов. Родственные фамилии — Шебанов, Шебунин, Шебаршов — образованы от тех же корней, но с разными суффиксами. Шебнов среди них — самая краткая и прямая по форме, что говорит о позднем оформлении: прозвище не успело обрасти дополнительными уменьшительными суффиксами.