Фамилия Шебуков образована от прозвища Шебук. Оно, предположительно, берет начало от глагола «шебунить» со значением «ковырять, копаться». Вероятно, именование Шебук отражает особенности характера его обладателя. Так могли назвать медлительного, задумчивого или рассеянного человека. Возможно также, что прозвище Шебук этимологически связано с прилагательным «шебутний», что в переводе с украинского языка на русский означает «шебутной». Очевидно, таким прозвищем нарекли непоседливого, эмоционального человека с беспокойным характером. Так и прозвище Шебук закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Шебуков. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шебук, со временем получил фамилию Шебуков.