Фамилия Шеколян — редкий случай, когда географический и языковой след почти очевиден, но точное значение исходного слова ускользает. По своей модели это типичная армянская фамилия с суффиксом -ян, который в русской передаче часто пишется через «о» (как Шеколян, а не Шекелян). Суффикс -ян в армянской ономастике означает принадлежность к роду или происхождение, то есть Шеколян — это «из рода Шекола» или «потомок человека по прозвищу Шекол».

Самая правдоподобная версия связывает основу «Шекол-» с армянским словом «шек» (շէկ) — «белокурый», «светлый», «русый». В таком случае Шекол — это прозвище светловолосого человека, а Шеколян — его потомки. Эта версия логична, потому что армянские фамилии от прозвищ по внешним признакам — распространённое явление. Менее вероятна связь с диалектным «шек» в значении «упрямый» или «своенравный»: такое прозвище тоже могли дать, но оно встречается реже и не имеет чёткой фиксации в словарях.

В русском контексте фамилия Шеколян не имеет славянских корней — ни суффикс -ян, ни основа не вписываются в восточнославянскую модель (где было бы что-то вроде Шеколов или Шеколин). Это чисто армянская фамилия, которая могла появиться в России в результате миграций XIX–XX веков. Географически она тяготеет к регионам с армянскими общинами: Краснодарский край, Ставрополье, Ростовская область, а также к крупным городам, куда переселялись армяне из Закавказья.

Интересная деталь: в армянском языке есть слово «шекол» (շէկօղ), которое в некоторых диалектах означает «светлая голова» в прямом смысле, а не как характеристика ума. Это могло быть и бытовое прозвище человека с заметно светлыми волосами на фоне тёмноволосого большинства. Таким образом, предки носителей фамилии Шеколян, скорее всего, выделялись внешностью и получили прозвище, которое закрепилось за родом.