Фамилия Шелтунова — женская форма, а мужская, Шелтунов, восходит к прозвищу Шелтун. Сразу бросается в глаза суффикс -ун-, типичный для русских прозвищ, образованных от глаголов: болтун, молчун, говорун. Шелтун, скорее всего, означает «тот, кто шепчет» или «тот, кто шуршит, издаёт шелест». Глагол «шелтать» в диалектах (особенно северных и сибирских) как раз и значил «шептать», «говорить тихо», а иногда — «болтать пустяки», «сплетничать». Человек с таким прозвищем мог быть негромким, вкрадчивым в разговоре или, наоборот, любителем пошептаться и посудачить.

Менее вероятная, но возможная версия связывает Шелтуна с диалектным словом «шелтуха» — так в некоторых областях называли мелкую рыбу, например, уклейку или пескаря. Тогда прозвище могло закрепиться за невысоким, юрким человеком, либо за рыбаком. Однако глагольная основа с суффиксом -ун встречается в русских фамилиях гораздо чаще, чем «рыбная» — поэтому версия с шептуном выглядит убедительнее.

Фамилия довольно редкая. Встречается в основном в центральной России и Поволжье, но не образует плотных гнёзд. По сословной принадлежности Шелтуновы могли быть и крестьянами, и мещанами — прозвище не указывает на знатное происхождение. Суффикс -ов в основе типичен для русских фамилий, оформившихся в XVI–XVII веках, хотя сама фамилия могла закрепиться и позже.

Интересная деталь: в старых документах фамилию могли писать через «о» — Шолтунов, что отражает акающее произношение. Такие варианты встречаются в переписях XIX века, но современное написание устоялось как Шелтунов. Таким образом, если вы носите фамилию Шелтунова, ваш предок, скорее всего, был человеком с тихой речью — либо тем, кого в деревне считали шептуном и сплетником.