Фамилия Шелушишин — редкий случай в русской ономастике. Её выделяет необычный суффикс. Если большинство русских фамилий заканчивается на -ов, -ев или -ин, то здесь мы видим сложную конструкцию: Шелуш-иш-ин. Суффикс -иш- в русских прозвищах часто имел увеличительное или пренебрежительное значение (например, «ручища», «домище»). Соответственно, Шелушиша — это прозвище человека, которого за что-то назвали «большим Шелухой» или «тем ещё Шелухой». А фамилия Шелушишин буквально означает «чей?» — «сын Шелушиши» или «потомок Шелушиши».

Корень здесь — «шелуш-», который восходит к слову «шелуха». В старину прозвище Шелуха давали либо человеку с шелушащейся кожей (например, из-за болезни), либо тому, кто занимался очисткой зерна, лущил его. В северных и центральных говорах «шелушить» означало «лущить, очищать от скорлупы». Таким образом, предок мог быть работником на мельнице или крестьянином, чья работа была связана с обработкой зерна.

По модели образования фамилия Шелушишин — типично русская, «домашняя». Она возникла в среде, где человека звали не по отцу, а по родовому дворовому прозвищу. Географически такие фамилии с суффиксом -ишин чаще встречаются в Поволжье и на Русском Севере, но точных данных по Шелушишину нет: фамилия крайне редкая, в современных справочниках упоминаний почти не встречается. В словаре Веселовского или Унбегауна она отсутствует, что говорит о её локальном бытовании.

С точки зрения социального статуса: фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или посадская. Владельцы такой фамилии вряд ли принадлежали к знати — суффикс -ишин в сочетании с «простонародным» корнем выдает происхождение из низших сословий. Если бы предок был боярином, фамилия звучала бы иначе — например, Шелухов или Шелушин.

Итог: Шелушишин — фамилия-загадка для этимолога. Она говорит о том, что предок был человеком с заметным прозвищем (возможно, связанным с внешностью или ремеслом), а сама фамилия сохранила редкую словообразовательную форму, которая в современном русском языке почти не встречается.