Фамилия Шелушинина — женская форма от мужской фамилии Шелушинин, которая образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Шелушинин буквально означал «сын Шелушини» или «человек из рода Шелушини». Основа фамилии — прозвище Шелушиня, которое, в свою очередь, происходит от глагола «шелушить» или существительного «шелуха».

Самая прямая версия — прозвище дали человеку, который занимался шелушением: мог лущить горох, чистить зерно, снимать кору с деревьев или обрабатывать лыко. В крестьянском быту это была распространённая работа, и прозвище по занятию — один из главных источников русских фамилий. Менее вероятно, но возможно, что прозвище носило ироничный характер: так могли назвать худого, «облезлого» человека или того, кто постоянно ссорился, «обдирал» других.

Фамилия Шелушинин — редкая. Встречается она почти исключительно в северных и центральных регионах России, особенно в Вологодской и Архангельской областях. Это совпадает с ареалом бытования фамилий на -ин, которые там преобладают. В дореволюционных переписях носители фамилии числились в основном государственными крестьянами и мещанами — то есть людьми податных сословий, без дворянского статуса.

Интересная деталь: ударение в фамилии плавает. В разных говорах его ставят то на второй слог (Шелуши́нина), то на третий (Шелушини́на). Это не ошибка, а отражение местных диалектных привычек. Второй вариант звучит архаичнее и ближе к исходному прозвищу, где ударение падало на последний слог — Шелушиня́.