Фамилия Шелупинин — одна из тех русских фамилий, которые образовались не от имени, а от прозвища, причём прозвища, уходящего корнями в диалектную лексику. На первый взгляд она кажется производной от слова «шелуха», но здесь всё немного сложнее и интереснее.

В основе фамилии лежит прозвище Шелупа или Шелуп. В русских говорах «шелуп» или «шелупай» могли называть небрежного, неопрятного человека, того, кто «ходит шелупнёй» — то есть небрежно одетым, обтрепанным. Однако есть и другая, более конкретная версия: в некоторых регионах «шелупом» называли скупого, прижимистого человека, который «обдирает» других, как шелуху. Возможно, прозвище относилось к человеку, который торговал вразнос или занимался мелким перекупством, «обдирая» покупателей.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность. Шелупинин — это «сын Шелупины», а Шелупина — жена или вдова Шелупы. Сама основа, Шелуп-, довольно редка. Встречаются однокоренные фамилии Шелупов, Шелупаев, но вариант с суффиксом -ин и удвоенным «н» (Шелупинин) встречается реже, что может указывать на более узкое географическое бытование — вероятно, северные или центральные области России, где фамилии на -ин особенно распространены.

Интересно, что в некоторых говорах слово «шелупень» означало не только неопрятного человека, но и особый вид короба или лукошка из лыка. Если прозвище дали мастеру, который делал такие короба, то фамилия могла возникнуть из профессионального прозвища. Но эта версия менее вероятна: обычно ремесленные прозвища имеют более прозрачные корни (Корзинкин, Лукошкин), а Шелупинин тяготеет к характеристике внешности или поведения.

Таким образом, предок современных Шелупининых, скорее всего, получил прозвище за свой характер или внешний вид — либо за неряшливость, либо за скупость. В любом случае, это прозвище было достаточно ярким, чтобы закрепиться за его потомками.