Фамилия Шептухин образована от прозвища Шептуха, которое восходит к глаголу «шептать». Скорее всего, прозвищем Шептуха нарекали человека, который очень тихо говорил. Кроме того, так нередко называли того, кто распространял слухи, сплетни, тайные разговоры. На Руси и на Украине Шептухами нарекали также колдунов, которые «колдуя, говорили приворот, нашептывание и наговор». Колдуны большей частью — люди старые, с длинными седыми волосами и нечесаными бородами, с длинными неостриженными ногтями. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шептуха, со временем получил фамилию Шептухин.