Фамилия Шибаихина — женская форма, а мужской вариант Шибаихин. Это редкая фамилия, и её разговорная, почти деревенская модель указывает на происхождение из северных или северо-восточных областей России, где были распространены фамилии на -ихин (как Шибаихин, Бороздихин, Копытихин). Модель простая: основа — прозвище или имя Шибай, затем суффикс -их- (указывающий на принадлежность к семье: «чей?» — Шибаихин, то есть «сын Шибаихи»), и окончание -ин.

Корень — «шибать» (бить, ударять, бросать, швырять). В русских говорах «шибай» могло означать: 1) человека, который шибает — бойкого, драчливого, склонного к ссорам; 2) в некоторых диалектах — торговца или перекупщика (от «шибать» в смысле «быстро сбывать товар»). Есть и версия, что «шибай» — это видоизменённое тюркское имя или прозвище (сравните с фамилиями Шибаев, Шибанов, где основа «шибан» — «удар, толчок» по-тюркски), но для формы Шибаихин тюркское происхождение менее вероятно: суффикс -ихин — исконно русский, северный, и фамилия скорее всего сложилась в среде крестьян или посадских людей, где прозвище давали по характеру или поведению.

С точки зрения словообразования, Шибаихин стоит в одном ряду с фамилиями вроде Скоробогатихин или Голопузихин — они фиксируют женскую линию: сначала женщина получала прозвище (Шибаиха — жена Шибая), а потом её дети становились Шибаихиными. Такая модель редко встречается в дворянских или купеческих родах, зато типична для крестьянского быта Русского Севера, особенно Вологодской, Архангельской, Вятской губерний. Если искать географию, то фамилия Шибаихин (и её женская форма) сегодня встречается точечно в Кировской области и в Пермском крае — это косвенно подтверждает северное происхождение.

Однокоренные фамилии — Шибаев, Шибанов, Шибалов — более часты и обычно восходят к тому же глаголу «шибать», но с разными суффиксами. Шибаихина выделяется именно редкой моделью: она не просто «сын Шибая», а «сын Шибаихи», что рассказывает о семейном укладе, где прозвище матери становилось основой для фамилии детей. Так что предки носительницы фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками из северных русских земель, а прозвище родоначальника — Шибай — могло достаться либо задире, либо расторопному торговцу.