Фамилия Шибалис — редкий случай в русском ономастиконе. Её выдает окончание: фамилии на -ис в массе своей не славянские, а литовские или польские. В Литве и пограничных областях Беларуси и Польши суффикс -ис (-is) — стандартное окончание фамилий мужского рода (как -ас, -ус). Поэтому первое и самое вероятное: Шибалис — литовская или полонизированная литовская фамилия, а её носитель — выходец из исторической Литвы или Жемайтии.

Корень — «шиба-». В литовском языке есть глагол šibėti (светиться, мерцать) и слово šibas (свет, сияние). Однако более убедительная версия связывает фамилию с литовским šibas в значении «хлыст», «прут» или с глаголом šibti (бить, хлестать). В таком случае прозвище Шибалис мог получить человек резкий, вспыльчивый, или же тот, кто пользовался прутом как орудием труда (пастух, плетельщик корзин). В славянских говорах тоже есть слово «шибать» (бить, кидать, ударять), но в сочетании с литовским окончанием оно выглядит как вторичное заимствование или калька.

Спорная версия — еврейская. Фамилии на -ис встречаются у евреев-ашкеназов, но обычно они происходят от имен (Берлис, Янкелис). Основа «Шиб-» нехарактерна для идиша или иврита, и без документальных подтверждений эту гипотезу стоит отбросить.

Словообразовательная модель проста: личное прозвище Шибалис (от šibti или šibas) перешло в фамилию без изменений, как это принято в литовской антропонимии. Русская письменная фиксация сохранила окончание -ис, что указывает на запись фамилии по документам (метрикам, ревизским сказкам) ещё в XIX веке, когда литовские фамилии в Российской империи не русифицировали, а оставляли в оригинальном виде.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу современной Беларуси (Гродненщина) и юго-востоку Литвы (Вильнюсский край). В России она встречается единично, чаще всего у потомков переселенцев из западных губерний. Социальный срез — крестьяне и мещане, без дворянских приставок.

Таким образом, Шибалис — почти стопроцентно литовская фамилия, образованная от прозвища, связанного с действием (бить, хлестать) или предметом (прут). Носитель — человек из балтийского языкового ареала, чьи предки получили фамилию не по отцу, а по личной черте или занятию.