Фамилия Шикеня — редкий случай, когда географическая привязка говорит больше, чем прозрачная этимология. Она почти наверняка западно- или южнославянская, а её основа — прозвище Шика, которое могло возникнуть в разных контекстах.

Словообразовательная модель указывает на белорусский или польский след. Суффикс -еня (-eń) в фамилиях на -еня типичен для восточных окраин Речи Посполитой: это уменьшительная или патронимическая форма, как в фамилиях Шипеня, Коваленя. Если перед нами патроним, то Шикеня — «сын Шики» или «маленький Шика». Человек с таким именем мог быть либо носителем прозвища, либо потомком того, кого так звали.

Что значило само прозвище Шика? Тут две основные версии. Первая — от глагола «шикать» (шипеть, шикать, подзывать или прогонять со звуком «ш-ш»). В таком случае Шикой могли прозвать человека с тихим, шипящим голосом, либо того, кто постоянно одёргивал других или командовал шёпотом. Вторая версия — от польского szykować (готовить, снаряжать) или szyk (строй, порядок). Шикой могли назвать аккуратного, подтянутого человека, любителя порядка, или, наоборот, в ироничном смысле — того, кто слишком суетится с приготовлениями. В словаре польских прозвищ встречается форма Szyka, что делает эту версию вполне правдоподобной.

Редкость фамилии в русском контексте объясняется тем, что она почти не встречается в центральных областях России. Основные очаги — Гродненская и Брестская области Беларуси, а также восточные воеводства Польши. В России Шикеня могла появиться в результате переселений конца XIX — начала XX века, либо как украинизированный или белорусизированный вариант фамилии Шикин (от Шика), но с сохранением местного суффикса.

Итог: фамилия Шикеня — скорее всего, белорусская или польская по происхождению, образованная от прозвища, связанного либо с манерой говорить (шикать), либо с характером (порядок, приготовление). Её носители — выходцы с западных окраин славянского мира, где такие формы были бытовой нормой.