Фамилия Шильчикова — женская форма от Шильчиков, и в ней сразу заметна редкость суффикса. Если бы фамилия звучала как Шильчков, её можно было бы принять за типичную «отчество» от прозвища Шильчок. Но суффикс -ик- (Шильчик → Шильчиков) подсказывает другую модель: основой послужило слово «шильник». В старину шильником называли мелкого торговца, коробейника, который ходил с товаром — иголками, нитками, а главное — с шильями. В словаре Даля «шильник» — это ещё и плут, пройдоха, человек, который «шилом бреет». Прозвище Шильник давали либо ремесленнику, выделывающему шилья, либо изворотливому, нечистому на руку человеку.

От Шильника образовалась уменьшительная форма Шильчик — так могли звать сына или младшего родственника. А уже от неё по патронимической модели (чей? — Шильчиков) возникла фамилия. В ономастике такая цепочка — от полного прозвища к уменьшительному и затем к фамилии — встречается реже, чем прямой переход от прозвища на -ов. Поэтому Шильчиков стоит в ряду фамилий, которые сохранили след не только профессии, но и внутрисемейного именования.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и поволжским областям: встречается в архивных записях по Тамбовской, Саратовской, Воронежской губерниям. В сословном плане носители почти наверняка были крестьянами или мещанами — дворянские роды с таким окончанием (-иков) редки и обычно имеют книжное, а не прозвищное происхождение.

Интересно, что в некоторых говорах «шильник» означало не только торговца, но и портного, работающего шилом. Если предок Шильчиковых был портным, фамилия получила бы двойную профессиональную привязку — и к инструменту, и к занятию. Спор между версиями «ремесленник» и «плут» разрешается в пользу первой: в крестьянской среде прозвища по профессии давали чаще, чем по моральным качествам.