Фамилия Шимигонов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа — Шимигон — не встречается в современных славянских именах или прозвищах, поэтому логичнее всего искать корни за пределами великорусской традиции. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от прозвища, которое принесли в русскую среду переселенцы или служилые люди с южных или западных земель.

Самый вероятный путь — связь с тюркским или монгольским миром. В тюркских языках корень «шим» или «шем» может означать «жир», «сало» или «тучный». Прозвище Шимигон (возможно, в форме Шимиген или Шимикон) давали человеку плотного телосложения, либо же оно было ироничным — для худого. Суффикс -он в таком прозвище — типичный для тюркских адаптаций, ср. Батыргон, Аймурзагон. При переходе в русскую среду фамилия получила стандартный патронимический суффикс -ов, то есть «сын Шимигона».

Менее популярная, но имеющая право на существование версия — связь с кавказскими языками. В осетинском, например, есть слово «шими» (в значении «тихий», «спокойный») и суффикс -гон, указывающий на принадлежность. Тогда Шимигон — «спокойный человек», «тихоня». Однако для этой гипотезы мало письменных подтверждений в русских переписных книгах.

Географически фамилия Шимигонов крайне редка. По данным переписей и телефонных справочников XX века, её носители встречаются в основном в Поволжье — в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской области. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: именно здесь столетиями жили татары, башкиры, чуваши, и русские фамилии с тюркскими корнями не редкость.

Обратите внимание на суффикс -ов. В отличие от фамилий на -ин (Шимигонин), форма на -ов указывает, что прозвище Шимигон воспринималось как имя существительное мужского рода. Если бы основа была женской (например, от имени Шимигона), мы бы получили Шимигонин. Этот грамматический нюанс говорит в пользу того, что прозвище дали мужчине, а не по матери.

В сословном отношении предки Шимигоновых, скорее всего, были государственными или ясачными крестьянами, реже — казаками. Дворянских родов с такой фамилией в «Бархатной книге» и других родословных сборниках не зафиксировано. Фамилия не получила широкого распространения, поэтому её носители — потомки одного или нескольких родов, расселившихся по Волго-Уральскому региону.