Фамилия Шимигонова — женская форма, мужской вариант — Шимигонов. В основе фамилии лежит прозвище или неканоническое имя Шимигон, которое, скорее всего, имеет составную структуру: корень «Шим-» и элемент «-гон». Первая часть может восходить к тюркскому или монгольскому имени Шим (встречается у татар, башкир, казахов как сокращение от Шимбай, Шимхан или самостоятельное имя), либо к русскому диалектному «шим» — шум, гам. Вторая часть «-гон» — редкий, но узнаваемый формант, который в русских прозвищах означал «гонитель», «преследователь» или «тот, кто гонит» (сравните: ветрогон, самогон, скоморох-гон). Таким образом, Шимигон — человек, который «гонит шум», то есть крикун, задира или, наоборот, зазывала. Впрочем, есть и более прозаичная версия: «шим» могло быть искажением от «шина» (в значении «колесо» или «обод»), и тогда Шимигон — мастер, подгоняющий шины, то есть колесник или тележник. Суффикс «-ов» указывает на принадлежность: Шимигонов — сын Шимигона. Фамилия редкая, её географическое ядро, судя по косвенным данным, — Поволжье и Приуралье, где активно смешивались русские, татарские и башкирские антропонимические традиции. Интересно, что в мужском варианте Шимигонов ударение, скорее всего, падает на третий слог — на «-го-», что нетипично для большинства фамилий на «-онов» (обычно ударение на «-ов»), но характерно для производных от двусложных основ. Точных сведений о сословной принадлежности носителей нет, но по модели образования фамилия крестьянская или мещанская, не дворянская.